Chromosome1-YAC-contigs(98-122cM)


Probe Size Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Markers Comments      
yUP8B8 180   mi193 (98.91)     yUP9E12L                     >1 location    
yUP8E8 300 mi116 (40.02) mi193 (98.91)                           >1 location    
yUP12E12 240 mi116 (40.02) mi193 (98.91)                           >1 location    
yUP24A8 260 mi116 (40.02) mi193 (98.91)                           >1 location    
CIC3E7 - mi116 (40.02) mi193 (98.91)                           >1 location    
CIC3E6 420 mi116 (40.02) mi193 (98.91)                           >1 location    
CIC11A7 670   mi193 (98.91)                                
yUP6E8 310   mi193 (98.91)                                
yUP8E5 200   mi193 (98.91)                                
yUP19G7 250   mi193 (98.91)                                
yUP4H11 270   mi193 (98.91)                                
                                       
yUP4A10 260   g4121(AC)                                
yUP13D8 200   g4121(AC)                                
yUP13F1 240   g4121(AC)                                
yUP18B8 20   g4121(AC)                                
yUP19C2 345   g4121(AC)                                
EG20E7 -   g4121(AC)                                
EG20H9 -   g4121(AC)                                
EG21A9 -   g4121(AC)                                
yUP14D9 170   g4121*                         *=Unconfirmed or weak      
yUP14G12 420   g4121*                         *=Unconfirmed or weak      
yUP15A9 330/280   g4121*                         *=Unconfirmed or weak      
yUP20F9 100   g4121*                         *=Unconfirmed or weak      
yUP22F11 190   g4121*                         *=Unconfirmed or weak      
CIC10E10 450 g17517 g4121(AC) K2                              
CIC6D1 450 g17517                                  
                                       
yUP17C10 100       mi185 (98.87)                            
yUP19E4 290       mi185 (98.87)                            
yUP24E3 280       mi185 (98.87)                            
CIC6E3 550 CDs8 (98.83)     mi185 (98.87) pCITd117* (100.44)                   *From BAC data      
CIC9H12 620 CDs8 (98.83) g4552 (100.94)   mi185 (98.87) pCITd117* (100.44)                   *From BAC data      
CIC7D8 470 CDs8 (98.83) g4552 (100.94) "182" mi185 (98.87)                            
CIC10G7 550     "182"       SR3                      
EG7F8 - DEF116                           Meyerowitz      
ABI9A1 180 DEF116                           Meyerowitz      
yUP2F3 350 yUP19H6L                                  
yUP2D12 350 yUP19H6L g4552 (100.94) g16595 yUP6D3R*                     *=Unconfirmed or weak >1 location    
yUP1H4 350   g4552 (100.94) g16595   pCITd117* (100.44)                   *From BAC data      
yUP7E6 250   g4552 (100.94)                                
yUP8H3 275   g4552 (100.94)                                
yUP11F3 320 yUP19H6L g4552 (100.94)                                
EG12F4 -   g4552 (100.94)     ABI9A1LE   EW2B8L                      
EG13H3 -   g4552 (100.94)                                
EG9G2 200         ABI9A1LE EW17B3LE EW2B8L               Meyerowitz      
EG6H11 -   g4552 (100.94)     ABI9A1LE EW17B3LE EW2B8L                      
EW17B3 140   g4552 (100.94)     ABI9A1LE EW17B3LE EW2B8L               Meyerowitz      
EW2B8 120   g4552 (100.94)     ABI9A1LE   EW2B8L               Meyerowitz      
EG17F1 170     EG17F1LE     EW17B3LE   EG8C8L                    
EG8C8 110     EG17F1LE         EG8C8L                    
EG3B1 160     EG17F1LE           ABI13A11L                  
ABI14G4-1 210     EG17F1LE ABI14G4-1LE       EG8C8L ABI13A11L   EG23G10L EW19A2L yUP1D11L          
ABI13A11 135     EG17F1LE         EG8C8L ABI13A11L                  
ABI15D7 150       ABI14G4-1LE           ABI15D7L EG23G10L   yUP1D11L          
EG23G10 160       ABI14G4-1LE   yUP1G3L       ABI15D7L EG23G10L   yUP1D11L          
EW19A2 -       ABI14G4-1LE           ABI15D7L EG23G10L EW19A2L yUP1D11L          
yUP1D11 360 pKY65     ABI14G4-1LE AP1 yUP1G3L         EG23G10L              
yUP1G3 160 pKY65       AP1 yUP1G3L                        
EW5H4 150 pKY65       AP1                          
EW18F6 140 pKY65       AP1                          
EW4H7 180 pKY65       AP1                          
                                       
yUP11B6 250   yUP11B6L mi462 (107.48) m453A (109.03)                            
yUP10C12 270     mi462 (107.48)                              
yUP11A8 290 m252 yUP11B6L                                
yUP15E11 290 m252 yUP11B6L                                
F5A21     F15I16ab mi462 (107.48) F2N3T7 T19M22ii   F2N11 F20P5   F19I21ab                
F20P5     F15I16ab mi462 (107.48) F2N3T7Sp6     F2N11 F20P5   F19I21ab                
F2N11   T10N8 T3P14   F2N3Sp6 T19M22ii F28H22b F2N11 F20P5 mi103 (108.49)                  
F10B24     T3P14     T19M22ii F28H22b F2N11   mi103 (108.49)                  
CIC6D4 420 nga128 (81.42) nga280 (81.42)   ve069         mi103 (108.49)             >1 location    
yUP6F9 290   nga280 (81.42)   mi303 (81.67)         mi103 (108.49)             >1 location    
yUP21G1 -   nga280 (81.42)   yUP6D3R*         mi103 (108.49)           *=Unconfirmed or weak >1 location    
yUP12G7 300                 mi103 (108.49)                  
F14L14   m252 T3P14 F5A18T7 f9a19t7   F22L14                        
F5A18   m252 f5a18sp6 F5A18T7Sp6 f9a19t7   F22L14                        
F15H11   F9K12 f5a18sp6 F5A18Sp6     F22L14                        
F22L14     f5a18sp6 F5A18Sp6     F22L14 CIC11B7                      
F8M17         f1206t7   F22L14                        
F12O6   F9K12     f1206t7   F22L14?                        
F10G9   F9K12 F10M8Sp6 F4A2T7 f1206t7 f26a9t7 T17G20       T18H11a CIC7E8 f10g5sp6 f23n20sp6 f3b19t7sp6        
F4A2   F9K12 F10M8Sp6? F4A2T7Sp6 f1206t7 f26a9t7         T18H11ab? CIC7E8 f10g5sp6 f23n20sp6 f3b19t7sp6        
F6E19   T31G22 F10M8Sp6 F4A2Sp6?   f26a9t7 PAB5 (110.42) F25O6? F7E12? F14O23 T17G20 CIC7E8     f3b19t7        
F8M3   T31G22 F10M8Sp6?     f26a9t7 PAB5 (110.42) F25O6 F7E12 F14O23 T17G20 CIC7E8     f3b19t7        
CIC4E4             PAB5 (110.42)*                 *=Unconfirmed or weak      
CIC1E9             PAB5 (110.42)*                 *=Unconfirmed or weak      
CIC7E8 490     "182" ve105 g13950 PAB5 (110.42)                        
yUP15C3 140           PAB5 (110.42)                        
CIC12A5 540       ve105 g13950                          
CIC2G10a 380         g13950                          
CIC11B11 420       ve105 g13950 PAB5 (110.42)                        
CIC12G10 560       ve105                            
CIC3F2 550     g8057 ve105                            
yUP18E12 200         g13950                          
CIC11B11 420         g13950                          
CIC12A5 540         g13950                          
CIC12G10 560         g13950                          
yUP8G2 300   g4721   yUP12F12L g13950                          
yUP7F6 330   g4721   yUP12F12L g13950               g17565 yUP20B1L        
yUP12F12 260       yUP12F12L yUP19H2R         nga111 (111.44)                
yUP24G1 70       yUP12F12L   g6838***             g17565          
yUP16F12 50       g8480                 g17565     >1 location    
yUP14H1 80                         g17565          
yUP24A7 10                         g17565          
yUP12A8 310                   nga111 (111.44)     g17565          
yUP21A5 -                   nga111 (111.44)                
CIC9C4 580       GER1 g13950 m315 (93.96)   JG4 JJ2 nga111 (111.44) ve050 ve116       >1 location    
CIC12H9 780       GER1 g13950     JG4 JJ2 nga111 (111.44) ve050 ve116            
CIC6H1 530 g14226 EIL3       AtCTRg chr5   JG4 JJ2 nga111 (111.44) ve050 ve116            
CIC2F9 400 g14226 EIL3 g8057     AtCTRg chr5                        
yUP14G9 140   EIL3                                
CIC9A6 410 g14226                                  
CIC2B11 480 g14226                                  
yUP6F5 600         yUP19H2R                          
yUP9A3 270-300         yUP19H2R                          
yUP19H2 550 mi100 (8.76)     yUP19H2L yUP7F4L g5957     g15894             chimera    
CIC2G2 420 g14226 EIL3 g8057 mi425 (113.89)                            
yUP1C12 160       mi425 (113.89)                            
yUP7A10 260       mi425 (113.89)                            
yUP8E7 320/150       mi425 (113.89)                            
yUP11A10 260       mi425 (113.89)                            
yUP15G11 120       mi425 (113.89)                            
yUP20E2 310       mi425 (113.89)                            
yUP24B4 330       mi425 (113.89)                            
CIC9H1 500       mi425 (113.89)     mi121-2 chr5                      
F2H22     F11K1 F2B18Sp6 mi425 (113.89)   F9E10 F2H22       F11D4              
F18H11 CIC10C4a   F11K1 F2B18Sp6 mi425 (113.89) F22K9 F9E10 F2H22   CIC2D3 T7B13 F11D4              
F4O3 CIC10C4a   yUP3G5 T9H3     f9e10sp6 mi121a f22h11sp6   T7B13                
F2D13     yUP3G5 T9H3       mi121a f22h11t7sp6   T7B13                
F1B16     yUP3G5 T9H3   f18a11t7     f22h11t7                    
F16N1     yUP3G5 T9H3   f18a11t7     f22h11t7                    
F26M20 F2P13     f5m4t7 m532 (114.52) f18a11sp6 F8L12                        
F2P13 F2P13     f5m4t7 m532 (114.52) f18a11sp6 F8L12                        
CIC6D10 460   ve126 ve131       mi121-2 chr5 CD3-42-2                    
CIC2D1 360   ve126     PC(AC)                          
CIC4F1 480   ve126     PC(AC) g6838   CD3-42-2                    
CIC11F4 670   ve126     PC     CD3-42-2   AthATPase (114.57)                
yUP4H9 240           g6838       AthATPase (114.57)                
yUP4B3 310       m532 (114.52)   g6838   B2 EW16B12L AthATPase (114.57)                
EW16B12 -               B2 EW16B12L                  
EW11G6 -               B2 EW16B12L                  
yUP13C10 300       m532 (114.52)   g6838   B2                    
EW1G5 -           g6838   B2                    
EG8D6 190     m237 m532 (114.52)   g6838   B2                    
yUP7C7 250   yUP7C7L m237 m532 (114.52)   g6838   B2                    
yUP15E6*** 20           g6838                        
EW6G11 - N7-24   S3   KG24                          
EW4E10 - N7-24   S3   KG24   EW6G11L                      
yUP17F5 150 N7-24   S3       EW6G11L                      
yUP7C8 260 N7-24 yUP7C7L         EW6G11L                      
yUP3G5 300 N7-24 yUP7C7L S3       EW6G11L       yUP23H9L       >1 location, BAC hyb data in 2 places      
yUP7E7 290   yUP7C7L                                
EG6A3 125     m237                              
EG9E5 -     m237                              
yUP4A12 340 yUP17A11R*                           *=Unconfirmed or weak >1 location    
yUP17A11 345 yUP17A11R*   m237     ADH (114.23)                        
EG4E2 200           ADH (114.23)                        
EG9G11 -           ADH (114.23)                        
EG13H7 -           ADH (114.23)                        
yUP6A6 150-280     msu31B3     ADH (114.23)                        
yUP6A7 290     msu31B3     ADH (114.23)                        
yUP7D10 250     msu31B3 yUP7D10L*   ADH (114.23)                 *=Unconfirmed or weak      
yUP3B7 300       yUP7D10L*                     *=Unconfirmed or weak      
yUP11E1 75       yUP7D10L*                     *=Unconfirmed or weak      
F26N21   F4A9T7 T10K14 T25H23         F7O12Sp6 F22K20   F1H20 f21h13t7sp6            
F20A22   F4A9T7 T10K14 T25H23           F22K20   F1H20 f21h13t7sp6            
F6G12   F4A9T7? T10K14 T25H23 yUP17A11               f21h13t7sp6            
F2P24   F4A9T7 T10K14 T25H23 yUP17A11   T4I3?         F1H20 f21h13t7sp6            
F14L6     T10K14 T25H23       F7F13                      
F13C10   F16N24T7 T10K14       T4I3? F7F13                      
F12F4   F16N24Sp6   F23L5 F4D23     F7F13 T25A18 T26P8 T32H6                
F6O11   F16N24Sp6   F23L5 F4D23   T4I3 F7F13 T25A18 T26P8 T32H6                
F4D23     F19F4? F23L5 F4D23 F14D21     T25A18 T26P8                  
F28K19   T7D2 F19F4 F23L5? F4D23 F14D21 F28K19 F2C5 T25A18 T26P8?   CIC10C4a              
F19F4   T7D2 F19F4   F4D23 F14D21 F28K19 F2C5       CIC10C4a              
F2C5     F19F4       F28K19 F2C5                      
CIC10C4 500 ve011 (116.10) ve097   g8480 nga6 chr3 nga112 chr3 mi121-2 chr5                 >1 location    
CIC7D2 410 ve011 (116.10) NIA1                                
EG7D9 -   NIA1                                
F14J10   T7D2 F3A23 F14J10 T1C5 T17C4 T22O22     F27J21   CIC10C4a              
F3A23   T7D2 F3A23 F14J10 T1C5 T17C4       F27J21                  
F2F15     F3A23 f2f15t7   T17C4 T22O22 F12L4 F20L11 F27J21 f3n1sp6                
F14E17     F3A23 f2f15t7   T17C4 T22O22 F12L4   F27J21 f3n1sp6 CIC10C4a              
F18F22       f2f15t7   T17C4       F27J21 f3n1sp6                
F3N1   T7D18   f2f15t7       F3J23     f3n1t7sp6                
F5I2     yUP8H12   T7G11     F3J23     f3n1t7                
F3J23     yUP8H12   T7G11   t22m9 F3J23     f3n1t7                
yUP2G8 360-390                           yUP20B1L        
yUP9A3 270-300                           yUP20B1L        
yUP20B1 330   yUP6B8L             yUP8H12R         yUP20B1L        
yUP20H8 400                 yUP8H12R                  
yUP20B6 290                 yUP8H12R                  
yUP8H12 300       AXR1 m488 (5.63)     yUP8H12L yUP8H12R     EW2H9L       chimera    
F17H14     yUP8H12 F14M1T7Sp6 F16N6   t22m9   F9C21 F10O8 f10o8t7?                
F14M1   CIC6C10? yUP8H12 F14M1T7Sp6 F16N6       F9C21   f10o8t7?                
F17C14   CIC6C10? yUP8H12 F14M1Sp6? F16N6 F7B5Sp6 F25I1Sp6 CIC3G12 F9C21 F10O8   CIC1E4              
F2B13   CIC6C10? yUP8H12 F14M1T7 F16N6 F7B5Sp6 F25I1Sp6   F9C21 F10O8   CIC1E4              
CIC11G11 500     ve043 (120.51) ve059                            
CIC6C10 465     ve043 (120.51) ve059 CIC6C10R                          
CIC10A11 530 m132A (121.05) g17311 (122.14) ve043 (120.51) ve059 CIC6C10R GL2                        
CIC1E4 610 m132A (121.05) g17311 (122.14) ve043 (120.51) ve059 CIC6C10R GL2                        
EG4G5 - m132A (121.05)                                  
EG13H5 - m132A (121.05)                                  
EG1D9 -   g17311 (122.14)                                
EG1D10 -   g17311 (122.14)                                
EG20A3 -   g17311 (122.14)                                
yUP12E9 140   g17311 (122.14)*                         *=Unconfirmed or weak      
F28G1     F23A5 F11N10 T9B14     F25M5 F22A2T7 F5I6 F9B4 F7K1              
F7K1     F23A5? F11N10 T9B14? T25E24?   F25M5 F22A2T7   F9B4                
F11N10   m132A (121.05) F23A5 F11N10 T9B14   mi157 (121.09)   F22A2T7 CIC1E4 F9B4 F7K1              
F23A5     F23A5 F11N10 T9B14       F22A2T7 CIC1E4 F9B4                
yUP7B8 240       mi15 (38.92)7*   mi157 (121.09)                 *=Unconfirmed or weak >1 location    
                                       
CIC5G4 495       gamma-TIP                            
CIC12G5 500       gamma-TIP                            
CIC12G9 370   g4121*   gamma-TIP                     *=Unconfirmed or weak      
                                       
CIC8G7a <100 g14148(MC)                                  
CIC9E12 - g14148(MC)                                  


Last Updated on 8/5/98
By ATGC at UPenn
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